Son 3, pues hay una debajo del disipador que esta justo debajo del socket del procesador, admas de que es esa misma la que cuenta con pcie 5.0, pues las otras 2 son pcie 4.0
Tambien ten en cuenta las lineas pcie que soporta tu procesador, pues si piensas llenar las ranuras m.2 puede que tu procesador se quede sin ancho de banda disponible para tu tarjeta gráfica